Kandungan
Protein terbentuk daripada rantai asid polimer atau asid amino. Susunan asid amino (bersama-sama dengan sebarang pengubahsuaian) menentukan struktur protein yang akan digunakan. Protein mempunyai empat tahap struktur: primer, sekunder, tertiari dan kuaterner. Struktur utama hanyalah urutan asid amino, sedangkan struktur sekunder merujuk pada struktur 3-D yang digunakan oleh segmen rantai asid amino.
Alpha helix
Helix alfa adalah sejenis struktur sekunder yang sangat biasa di mana rantai asid amino mengalihkan untuk membentuk gegelung yang halus. Nitrogen ikatan petid dalam setiap asid amino mempunyai hidrogen terikat kepadanya, supaya ia dapat membentuk sejenis interaksi yang disebut ikatan hidrogen dengan atom oksigen kumpulan karbonil setiap ikatan. Bon hidrogen memegang kipas bersama dan membantu mengekalkan bentuknya.
Rantaian sampingan
Semua rantaian asid amino titik helik alpha ke luar, yang menjadikan gelung lengkap setiap 3.6 asid amino. Kipasnya dipintal mengikut arah jam, sehingga kadang-kadang digambarkan sebagai "betul". Protein mungkin termasuk beberapa heliks alfa, dan beberapa protein seperti keratin (protein yang terdapat di rambut dan kuku) mempunyai struktur jenis ini sepanjang kebanyakan panjangnya.
Lembaran beta
Lembaran beta juga dipegang bersama oleh ikatan hidrogen, tetapi dalam kes ini dua kawasan polipeptida diposisikan bersebelahan, dan ikatan hidrogen memegangnya bersama-sama dalam satu helaian kertas lapis. Kabel berpasangan boleh sama ada berputar dalam arah yang bertentangan, di mana ia bersifat antiparallel, atau mereka mungkin selari, dengan kedua-dua helai berkongsi arah yang sama. Susunan antiparallel adalah lebih umum. Asid rantaian asid amino alternatif menunjuk ke atas dan ke bawah, serenjang dengan satah lembaran.
Pertimbangan
Polipeptida boleh merangkumi beberapa helaian beta dan bahagian heliks alfa sebagai sebahagian daripada struktur 3-D mereka keseluruhan atau struktur tersier. Polipeptida tunggal mungkin protein sahaja, atau beberapa boleh mengikat untuk membentuk protein. Jika pelbagai polipeptida terlibat, perkiraan ruang mereka dipanggil struktur kuarum. Struktur sekunder merujuk secara khusus kepada ciri-ciri helix alfa dan helaian beta. Sebagai struktur tertiari dan kuaternary, struktur sekunder mungkin menjadi bercelaru atau diturunkan melalui penggunaan suhu tinggi dan / atau perubahan ketara dalam pH.