Kandungan
Pewarna membantu dalam mengenal pasti dan membezakan komponen sel dan tisu. Komponen ini cenderung telus dan pewarna memberi penonton alat untuk melihat apa yang tidak dapat dilihat oleh mata manusia. Pewarna paling kerap digunakan dalam kajian mikrobiologi, histologi dan sitologi. Berikut adalah beberapa pewarna yang paling banyak digunakan.
Bismarck Brown
Bismarck brown kini kurang digunakan berbanding zaman dahulu. Pewarna ini menandakan mukin (sejenis protein yang terdapat dalam lendir dan air liur) yang berasid dan bertukar menjadi kuning.
Carmine
Carmine adalah pewarna yang digunakan untuk mewarnai glikogen (pati haiwan), glikosaminaglis (rantai gula yang terdapat pada lendir dan cecair sendi) dan inti sel. Ia mewarnai bahagian-bahagiannya dengan warna merah dan dibuat dari serangga Coccus cacti. Ia lebih dikenali sebagai mealybug. Serangga ini berasal dari Mexico dan barat daya Amerika Syarikat dan memakan kakti. Pewarna dibuat dari cairan tubuh serangga.
Kristal ungu
Kristal ungu mengotorkan dinding sel ungu apabila digabungkan dengan mordant, yang merupakan campuran bahan yang bertindak balas dengan pewarna untuk membentuk pepejal yang tidak larut dan berwarna. Ia dapat digunakan dalam klasifikasi bakteria dan merupakan pewarna yang digunakan dalam teknik pewarnaan Gram. Di dalamnya, sel-sel pertama diawetkan dengan proses penyediaan dan kemudian diwarnai dengan kristal ungu. Pewarna diserap dalam jumlah yang sama oleh semua bakteria. Setelah menggunakannya, mordant digunakan dan slaid dicuci dengan larutan alkohol 95%, kemudian diwarnai dengan pewarna yang lebih ringan dengan warna lain (biasanya safranin). Teknik ini adalah kaedah utama yang digunakan dalam kajian bakteria di makmal.
Eosin
Eosin adalah pewarna sintetik berasaskan alkohol. Ia mengotorkan sel darah, bahan sitoplasma (bahan yang terdapat di antara membran sel dan nukleus), membran sel dan struktur di luar sel merah jambu atau merah. Ia digunakan sebagai salah satu pewarna teknik pewarnaan Hematoxylin dan Eosin. Teknik ini paling banyak digunakan dalam kajian tisu dan sel, untuk memerhatikan bentuk dan strukturnya.
Hematoksilin
Hematoxylin adalah pewarna yang menyertai eosin dalam teknik H&E. Ia mengotorkan inti sel biru-ungu atau coklat. Ini adalah pewarna semula jadi yang dibuat menggunakan pokok bernama campeche (Haematoxylum campechianum).
Safranina
Safranin digunakan sebagai salah satu pewarna dalam teknik pewarnaan Gram dan mengotorkan inti sel berwarna merah. Ia juga digunakan untuk mewarnai tulang rawan. Ia bertukar menjadi kuning apabila dicelup dengan safranin.